关于汇算清缴后取得上年费用发票的处理方式，综合权威信息整理如下：

一、补开发票的处理

1. 要求补开发票

   若汇算清缴后取得上年度发票，企业应要求对方在当年度补开或换开发票、其他外部凭证。补开后的凭证需符合税务机关规定，方可作为税前扣除依据。

2. 特殊情况处理

   若因对方原因无法补开发票，企业可提供合同、协议等能证明支出真实性和合法性的资料，经税务机关审核确认后，可作为税前扣除依据。

二、追补扣除的处理

1. 未扣除或少扣除的支出

   对于汇算清缴时已发现但未扣除或少扣除的上年费用，企业可在发现当年进行专项申报，提供充分证明材料后追补扣除。

   • 追补期限 ：根据《国家税务总局关于企业所得税若干问题的公告》，追补确认期限不得超过5年。

2. 费用归属年度确认

   追补扣除需在支出实际发生的纳税年度进行核算，不得提前或延后。

三、注意事项

1. 及时性原则

   费用应遵循权责发生制原则，及时计入当期成本费用。若长期未取得发票，可能影响当年度所得税前扣除。

2. 税务风险控制

   • 汇算清缴后变更申报需通过税务机关审核，可能涉及更正申报流程，需谨慎操作。

   • 建立发票管理档案，确保所有支出均有合法凭证，避免因凭证不全引发税务风险。

3. 操作建议

   • 及时与供应商沟通补开发票事宜，避免影响次年申报。

   • 对大额支出或复杂业务，可咨询税务机关或专业机构确认处理方式。

综上，汇算清缴后取得上年费用发票可通过补开发票或追补扣除两种方式处理，需根据具体情况选择合适方案，并确保符合税务机关规定。