南通市针对特殊病门诊的报销政策旨在减轻患有重大疾病且需要长期门诊治疗的参保人员的经济负担。根据最新的政策，对于特定的门诊特殊病种，如恶性肿瘤（包括放疗、化疗、介入治疗、生物靶向药物治疗、内分泌治疗）、慢性肾功能衰竭（血液透析、腹膜透析）、器官移植术后抗排异治疗等，设置了年度起付标准为600元。

对于这些特定的门诊特殊病种，医保基金支付的比例按照2023年度相应住院标准执行。这意味着，在符合条件的定点医疗机构进行门诊治疗时，报销比例将与同级别医疗机构的住院报销比例相同。例如，如果是在二级医疗机构进行门诊治疗，但该机构没有等级划分，则报销比例会按照2023年的二级医疗机构的标准来计算。

对于其他门诊特殊病种以及严重精神障碍患者，不设起付标准。若患者同时患有两种或以上的门诊特殊病种，则在一年内只计算一次起付标准。

具体到报销比例方面，门诊特殊病种的报销比例通常较高。例如，对于一些严重的慢性病和特定的重大疾病，如恶性肿瘤门诊治疗、尿毒症透析等，报销比例可以达到90%-95%。而对于职工医保中的门诊慢特病专项报销，在职人员的报销比例可以在80%-89%之间，退休人员则可能享受更高的报销比例，达到85%-91%。

值得注意的是，对于某些特殊情况下的费用报销，比如终末期肾病透析治疗，每年最高可报销6000元，并按70%的比例报销。而肺动脉高压的治疗费用，每年最高限额为80000元，按60%的比例报销。

为了进一步方便参保人享受待遇，已办理居民“两病”（高血压、糖尿病）及门诊特殊病待遇备案的参保人，可以在符合规定的定点医疗机构直接使用医保电子凭证或社会保障卡享受相关待遇。

申请特殊病门诊待遇的过程相对明确：符合条件的参保人需提交由本市具有相应资质的二级及以上定点医疗机构副主任医师或以上职称的医生出具并经医院医保办盖章的相关申请表及相关病历资料至市政务中心医保服务窗口办理。

南通市对特殊病门诊的报销政策不仅考虑到了不同疾病的治疗需求，还通过设定不同的报销比例和起付标准来确保患者能够获得必要的医疗支持，减轻其经济压力。不过，具体的报销细节可能会因个人情况和地区差异有所不同，因此建议有需要的市民咨询当地的医保部门以获取最准确的信息。