根据搜索材料和我的知识，以下是医保余额不显示公司缴纳部分的可能原因：
- 1.缴纳的医保类型不同：如果公司缴纳的是住院医疗而非综合医疗，住院医疗缴费比率较低，交的钱少，住院时报销比率与综合医疗差不多，但没有余额打至你的社保卡中例如，深圳的医保分为三档，只有参加深圳基本医疗保险一档（原综合医疗）的人才有医保个人账户，而参加二档（原住院医疗）和三档（原劳务工医疗）的人没有个人账户
- 2.查询方式不正确：医保余额的查询方式可能不正确。例如，使用银行的ATM机查询社保卡，只能查询到金融账户的额度，而社保个人账户的金额需要通过定点医疗机构或官网查询你可以通过支付宝或微信等第三方平台绑定社保卡后，直接查询余额
- 3.系统延迟：当月缴纳社保后，代扣成功后需要一定的工作日才能到账，系统会产生延迟。因此，公司已经扣款，但网上却没有显示余额
- 4.社保卡未激活：社保卡没有激活，也是无法正常查询社保卡余额的
- 5.个人账户金额用完：如果个人账户中的金额已经用完，也会显示没有余额
- 6.灵活就业人员参保：如果是以灵活就业人员身份参保，一般没有个人账户，因此会显示余额为零
- 7.医保缴纳的档次不同：不同地区的医保政策不同，缴纳的档次也不同。例如，东莞的金卡才有个人账户，银卡没有个人账户
- 8.新参保人员：新参保人员，个人账户金额还没有划入，余额显示为0
- 9.社保卡未及时更新：如果社保卡还是旧版，没有更新到最新的版本，查询时也会显示余额为0
- 10.城乡居民医保：如果缴纳的是城乡居民医保，这种情况下不建立个人医保账户，余额为0
建议你可以先确认自己缴纳的医保类型和查询方式是否正确，如果仍然有问题，可以联系公司社保负责人或当地社保机构进行进一步咨询。