吉大一院（吉林大学第一医院）和吉大二院（吉林大学第二医院）的耳鼻喉科各有优势，无法一概而论哪个更好，具体选择取决于患者的具体需求和情况。以下是对两家医院耳鼻喉科的详细分析：
一、吉大一院耳鼻喉科
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历史悠久：成立于1960年，经过多年发展，已成为集医疗、教学和科研为一体的综合医疗机构。
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科室规模与资源：作为大型综合性医院的科室，拥有丰富的医疗资源和先进的医疗设备。
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专业实力：在耳鼻咽喉科常见疾病的治疗方面有较高水平，尤其在头颈部肿瘤、喉癌的外科治疗及鼻窦镜治疗鼻部疾病等方面具有专长。
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专家团队：拥有一批经验丰富的专家，如祝威主任医师等，他们在耳鼻咽喉科领域有着深厚的造诣。
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科研成果：在教学和科研方面取得了显著成绩，是国内较早的耳鼻咽喉专业博士学位授权单位，发表了大量高水平学术论文，承担了多项国家和省部级科研项目。
二、吉大二院耳鼻喉科
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专科特色：在眼科、皮肤、耳鼻喉等小科方面更具优势，耳鼻喉科是其重点发展科室之一。
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技术水平：在某些领域如功能性鼻内窥镜手术、耳鼻咽喉肿瘤手术、阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合症（OSAHS）的手术等方面技术力量较强，且处于省内领先地位。
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设备先进：配备了德国Storz硬质鼻内窥镜手术系统、美敦力耳鼻咽喉科手术动力系统等多项先进医疗设备，为耳鼻咽喉科疾病的诊断治疗提供了有力支持。
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专家经验：科室医生均先后在上海眼耳鼻喉科医院、北京同仁医院等知名医院进修深造，专科技术力量在常武地区首屈一指。
两家医院的耳鼻喉科都有各自的优势和特点。吉大一院耳鼻喉科在综合实力、科研成果和专家团队方面表现突出；吉大二院耳鼻喉科则在眼科、皮肤等小科方面更具优势，且在某些特定领域的技术水平和设备先进性方面表现不俗。患者可以根据自己的病情和需求，选择适合自己的医院就诊。