昆明中医院和云南省中医院各有其优势，选择哪个医院更好取决于您的具体需求。以下是两家医院的对比分析：
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昆明中医院：创建于1956年，是全国示范中医医院，云南省中医学院第三附属医院，云南省中医名院。医院拥有专业技术人员646名，其中高级职称人员74名，国家级中医带教导师两名，国家级继承人五名，云南省有突出贡献的优秀技术人员三名（同时享受国务院特殊津贴待遇）。设有昆明市中医急症中心、省肛肠研究中心、昆明市中医中药研究所等机构。
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云南省中医院：云南省唯一的省级中医医院，始建于1947年，1994年被评定为三级甲等中医医院，2007年被评为云南省中医名院，2012年复审再次被评为三级甲等中医医院。医院现有滇池、光华两个院区，实行云南省中医医院、云南中医药大学第一附属医院、云南中医药大学第一临床医学院、云南省中医医疗集团总医院、云南省针灸推拿康复医院、云南省中医皮肤病专科医院六块牌子一套班子的管理运行模式。
两家医院都是三级甲等中医医院，都有较高的医疗水平和丰富的医疗资源。如果您需要更专业的中医服务，可以选择云南省中医院；如果您更看重医院的综合能力和科研实力，可以选择昆明中医院。最终选择哪家医院，建议您根据自己的实际情况和需求进行决定。