在南通治疗结膜炎，公立三甲综合医院的眼科和专业眼科机构是首选，重点推荐 南通大学附属医院眼科（江苏省临床重点专科）、南通市第一人民医院（眼科微创技术成熟） 以及 爱尔眼科南通医院（干眼症及过敏性结膜炎特色门诊），这些机构以专业的诊疗团队、精准的检测设备和分层治疗方案为亮点，尤其适合反复发作或伴随视力变化的复杂病例。
南通大学附属医院 的眼科拥有独立的眼表疾病诊疗中心，配备 角膜共聚焦显微镜 和 泪液成分分析仪，可快速区分细菌性、病毒性或过敏性结膜炎。针对 儿童结膜炎，该科室开发了无刺激冲洗疗法，减少患儿治疗抗拒。医师团队中有 4 名主任医师每周轮值门诊，年均接诊结膜炎患者超 3000 例，复发率控制在 5% 以内。
南通市第三人民医院 在 感染性结膜炎 治疗领域优势突出，依托医院感染病学科背景，建立了结膜分泌物 微生物快速检测通道，3 小时内可明确致病菌种类。针对耐药性金黄色葡萄球菌等顽固感染，采用 局部抗生素联合中药熏蒸 方案，疗程缩短 30%。
南通市中医院眼科 擅长 慢性结膜炎的中西医结合调理，独创“清肝明目贴”配合睑缘清洁术，改善眼干、异物感等症状。其研发的 中药雾化熏眼仪 可将药液微粒直达结膜囊，对过敏性结膜炎导致的充血水肿有效率超过 85%。
爱尔眼科南通医院 的优势在于 精准分型治疗体系，通过 过敏原筛查 和 泪膜稳定性检测 区分病因，针对尘螨过敏患者提供脱敏治疗。该院引进的 IPL 强脉冲光治疗仪 可阻断炎症因子释放，对春季卡他性结膜炎疗效显著，患者满意度达 92%。
出现眼红、分泌物增多等症状时务必 48 小时内就诊，避免随意使用网红眼药水。儿童患者建议优先选择配备儿童专用检查设备的医院，如南通大学附属医院；过敏体质或长期戴隐形眼镜者，可考虑爱尔眼科的过敏门诊或干眼诊疗中心。