20个工作日内（政策目标），当前实际多为30天至3个月
药店医保结算周期受地区经济、医保基金运行状况及政策推进阶段影响，当前实际中经济发达地区多为30-45天，中部地区2-3个月；国家正推进即时结算改革，2025年目标为80%统筹地区实现20个工作日内结算，2026年全面覆盖。
一、政策目标与当前现状对比
国家即时结算政策目标
2025年1月，国家医保局明确推进基本医保基金即时结算改革，要求2025年底全国80%统筹地区基本实现即时结算（申报截止次日起20个工作日内拨付），2026年所有统筹地区全面覆盖。当前不同地区实际结算周期
受地区财政、基金充裕度等因素影响，当前实际结算周期差异显著：经济发达的江浙地区最快30-45天，河南、湖北等中部地区最快2-3个月，3个月以上结算周期为常态。
| 地区类型 | 当前结算周期 | 政策目标周期（2025年） |
|---|---|---|
| 经济发达地区 | 30-45天 | 20个工作日内 |
| 中部地区 | 2-3个月 | 20个工作日内 |
| 其他地区 | 3个月以上 | 20个工作日内 |
二、影响医保结算周期的关键因素
地区财政与基金充裕度
医保结算需依赖财政拨付，若地方财政资金不足或医保“资金池”不充裕，结算周期可能顺延至下一年；基金当期赤字或预计赤字的统筹地区，无法申请预付金。药店合规与考核结果
药店需医保绩效考核合格且12个月内无欺诈骗保记录方可申请预付金；频繁被扣考核分的药店，可能影响结算效率。政策推进阶段
2025年为即时结算改革试点与全面启动阶段，截至5月已有77%统筹地区启动，覆盖36.18万家医药机构；随着政策推进，结算周期将逐步缩短。
三、改革带来的具体变化
结算模式多样化
各地区结合实际选择不同模式：180个地区实行高频拨付（1-7个工作日到账），223个地区压缩月结算周期至20日内，19个地区按月预拨资金。资金周转效率提升
即时结算显著缩短回款周期，例如安徽某医院改革后医保资金次日到账，释放的资金可用于设备采购、人员薪酬等，提升运营灵活性；药店垫资压力缓解，促进医药产业良性循环。
医保即时结算改革正加速推进，通过缩短结算周期、优化支付模式，既缓解药店资金压力，又提升医保基金使用效率，未来随着政策全面覆盖，参保群众与医药机构将共同受益于更高效、规范的医保服务。