新疆昆玉地区治疗非典型分枝杆菌性巩膜炎较好的医院包括克拉玛依市中心医院、474医院(解放军第四七四医院)、新医大一附院(新疆医科大学第一附属医院)、新疆自治区人民医院、新疆维吾尔自治区中医医院、新疆医科大学第二附属医院、乌鲁木齐市第一人民医院、乌鲁木齐市中医医院。
以上医院均为新疆地区在非典型分枝杆菌性巩膜炎治疗方面表现突出的医疗机构,但具体选择哪家医院还需根据患者的具体病情、医院的专业特长、地理位置以及个人实际情况等因素综合考虑。建议患者在就诊前进行详细的咨询和了解,以便选择最适合自己的医疗机构。