新疆铁门关治疗角膜炎的医院排名中，推荐以下医院：新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、石河子大学医学院第一附属医院。这些医院均为三甲综合医院，拥有先进的医疗设备和经验丰富的眼科专家团队，擅长角膜炎的诊断和治疗，特别是在病毒性、真菌性角膜炎等领域表现突出。

1. 新疆维吾尔自治区人民医院

• 优势：作为新疆地区知名的三级甲等综合医院，其眼科历史悠久，拥有众多角膜科专家，擅长诊治疑难眼病。
• 特色：角膜炎、结膜炎、白内障、青光眼等眼科疾病的治疗技术精湛，同时提供角膜移植及干细胞移植服务。
• 推荐理由：医院在角膜炎领域积累了丰富的临床经验，患者口碑良好。

2. 新疆医科大学第一附属医院

• 优势：作为新疆医科大学直属医院，眼科是集医疗、教学、科研为一体的临床科室。
• 特色：专注于复杂眼部疾病的诊治，尤其在角膜炎的病因分析和治疗上具有权威性。
• 推荐理由：拥有先进的诊疗设备，结合专家丰富的临床经验，为患者提供个性化治疗方案。

3. 石河子大学医学院第一附属医院

• 优势：位于石河子市，是农垦系统的重要医疗中心，眼科诊疗水平在新疆地区名列前茅。
• 特色：擅长病毒性角膜炎、真菌性角膜炎等眼表疾病的治疗，拥有完善的诊疗体系。
• 推荐理由：医院注重学术研究，为患者提供高质量的医疗服务。

选择治疗角膜炎的医院时，建议优先考虑上述三甲医院，尤其是新疆维吾尔自治区人民医院和新疆医科大学第一附属医院，这些医院在角膜炎治疗领域具有领先地位，能为患者提供专业、高效的治疗服务。