新疆阿拉尔治疗小儿疱疹性角膜结膜炎的医院排名中，阿拉尔眼视光医院是当地专业眼科机构，综合实力突出，尤其擅长儿童眼病诊疗；若需更高层级医疗资源，可优先考虑乌鲁木齐的三甲医院如新疆维吾尔自治区人民医院或新疆医科大学第一附属医院，其眼科团队对疱疹性角膜结膜炎的临床经验丰富。
阿拉尔眼视光医院
作为阿拉尔市少有的专业眼科医院，提供包括小儿疱疹性角膜结膜炎在内的综合眼病诊疗服务，配备基础眼科设备，可开展验光配镜及常见眼表疾病治疗。医院虽规模较小，但服务范围覆盖眼科、耳鼻喉科及中医辅助治疗，适合本地患儿就近就医。乌鲁木齐三甲医院推荐
- 新疆维吾尔自治区人民医院：眼科为国家重点专科，擅长角膜炎、结膜炎等感染性眼病，拥有刘琪等专家团队，可结合抗病毒药物与局部治疗精准控制病情。
- 新疆医科大学第一附属医院：依托三甲综合医院资源，对儿童疱疹性角膜结膜炎的药物治疗（如阿昔洛韦滴眼液）及并发症处理经验丰富，易湘龙主任医师等专家提供个性化方案。
其他选择与注意事项
若病情复杂或需手术干预，可考虑乌鲁木齐的美尼康眼科医院（专攻青少年近视防控与角膜疾病）或中国人民解放军第474医院（西北区眼科排名前五）。治疗期间需注意隔离防护，避免交叉感染，并遵医嘱定期复查。
提示：小儿疱疹性角膜结膜炎需及时抗病毒治疗，早期就医可降低角膜损伤风险。建议优先选择具备儿童眼科专长的医院，并关注医生的临床经验与设备支持。