新疆塔城治疗炎症性肠道疾病及其伴发的葡萄膜炎的医院排名中，新疆生产建设兵团第九师医院、沙湾县人民医院、新疆塔城地区托里县人民医院、额敏县人民医院、塔城市人民医院在治疗葡萄膜炎方面表现较好。而对于炎症性肠病的治疗，新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学第二附属医院等医院排名靠前。
以下是具体分析：
新疆生产建设兵团第九师医院、沙湾县人民医院、新疆塔城地区托里县人民医院、额敏县人民医院、塔城市人民医院：这些医院在治疗葡萄膜炎方面有较好的口碑和医疗实力，可以为患者提供专业的眼科医疗服务。
新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院、新疆医科大学第二附属医院：这些医院在治疗炎症性肠病方面具有丰富的经验和先进的医疗设备，能够为患者提供全面的诊疗服务。
塔城地区人民医院：作为一所三级甲等综合医院，塔城地区人民医院在眼科领域也有较强的实力，可以为患者提供葡萄膜炎的治疗服务。
新疆医科大学第一附属医院：该医院还设有炎症性肠病关爱中心，为患者提供舒适、安全、标准化的输注治疗环境，并优化预约机制，缩短患者就诊等待时间。
在选择医院时，患者应根据自身病情和需求，结合医院的专业特长和口碑，选择合适的医院进行治疗。炎症性肠道疾病及其伴发的葡萄膜炎需要综合治疗，患者应在医生指导下进行规范的治疗和管理。