根据搜索结果，2025年上海在腹痛治疗领域具有较高水平的医院主要包括以下几家，分类整理如下：

一、综合医院

1. 上海交通大学医学院附属仁济医院

   妇科在痛经、妇科炎症等腹痛相关疾病治疗中表现突出，注重个性化治疗方案制定。

2. 上海交通大学医学院附属新华医院

   疼痛科为全国第四名专科，擅长中西医结合治疗腹痛，尤其在神经性疼痛、炎症性疼痛等方面有先进技术。

3. 上海交通大学医学院附属瑞金医院

   三级甲等综合医院，腹膜炎等急症治疗经验丰富，诊疗团队专业且设备先进。

4. 复旦大学附属中山医院

   针对肝胆系统相关腹痛（如肝炎、胆道疾病）有深厚积累，诊疗水平国内领先。

5. 上海长海医院

   三级甲等公立医院，腹膜炎诊断与治疗处于国内前沿，探索创新疗法。

6. 上海市第六人民医院

   申康医院集团旗下三甲医院，擅长腹痛的精准诊断与综合管理。

二、专科医院

1. 上海中佑肛肠医院

   肛肠、胃肠疾病专科医院，医保覆盖率高（95%），擅长复杂肛肠手术及炎症性疾病治疗。

2. 上海金山儿童医院

   儿童腹痛相关疾病（如肠炎、肝胆疾病）的诊疗中心，综合评分高，设备先进。

三、其他推荐机构

• 复旦大学附属妇产科医院 ：妇科疾病（如痛经、子宫内膜异位症）的权威治疗机构。

• 上海公共卫生中心医院 ：儿童腹痛、肝胆疾病的专业诊疗平台。

四、选择建议

• 急症处理 ：优先选择综合医院疼痛科或专科医院（如中佑肛肠、瑞金医院）。

• 专科治疗 ：妇科、儿科或肝胆疾病需针对性医院（如仁济医院、金山医院）。

• 预约挂号 ：可通过医院官网或“手机名医汇”等平台预约。

以上医院均具备丰富的临床经验和技术实力，可根据具体病症选择合适机构。