甘肃甘南治疗韦格纳肉芽肿性巩膜炎推荐选择甘南藏族自治州人民医院、舟曲县人民医院或玛曲县人民医院。其中，甘南州人民医院作为三级乙等综合医院，具备更完善的专科设备和多学科协作能力；舟曲县人民医院和玛曲县人民医院均为二甲医院，眼科基础诊疗经验丰富，适合轻中度患者就近就医。
甘南藏族自治州人民医院 是当地唯一地市级综合医院，承担全州疑难重症诊疗任务，眼科可开展复杂巩膜炎的综合治疗，并依托互联网医疗实现远程会诊。舟曲县人民医院 五官科配备基础眼科诊疗设施，提供预约挂号和线上问诊服务，适合稳定期患者随访。玛曲县人民医院 急诊科和五官科联动性强，对急性发作症状处理较及时。
韦格纳肉芽肿性巩膜炎需联合免疫抑制剂和糖皮质激素治疗，建议优先选择能提供风湿免疫科与眼科协作的医院。若病情危重或合并全身多系统损害，可考虑转诊至兰州的甘肃省人民医院，其眼科专家团队在葡萄膜炎、视神经炎等疑难眼病领域经验更丰富。
就诊前建议通过医院官网或电话确认眼科医生在岗情况，部分县级医院可能存在专科医生临时外派学习的情况。若出现巩膜穿孔倾向，需立即前往具备巩膜加固术条件的医院。
日常需严格遵医嘱用药，定期监测血常规和肝肾功能，避免感染和过度用眼。早期规范治疗可显著降低失明风险。