南京市医保住院报销手续并非必须线下办理，具体分为以下两种方式：
一、线上办理（推荐）
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“我的南京”APP
通过“我的南京”APP的医保服务模块，选择“零星报销掌上预审”功能，上传门诊病历、住院病历、费用明细等材料，审核通过后通过邮寄方式提交材料至医保经办机构。
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“江苏医保云”APP
同样支持线上预审，操作流程与“我的南京”APP类似，需上传材料并选择就医地及参保险种。
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南京市医疗保障局官网
访问官网后，通过“网上办事”平台提交电子材料，部分流程支持不见面办理。
二、线下办理
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医保经办机构窗口
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职工医保 ：持身份证或社保卡、疾病诊断证明书原件到市本级或新六区医保经办机构办理。
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城乡居民医保 ：需携带有效身份证明到户籍地或居住地街道/社区医保经办机构办理。
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异地就医备案后处理
若已办理异地就医备案，出院时可直接在定点医疗机构刷卡结算；未备案者需提供住院发票、费用明细等材料到医保经办机构申报。
注意事项
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线上办理需确保材料清晰可辨，且部分平台需注册并绑定医保账号。
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线下办理需注意医保经办机构的办公时间，部分区域可能需提前电话咨询。
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所有报销材料收取后不予退还，建议提前复印留存。
如需进一步确认，建议通过南京市医疗保障局官网或拨打医保热线咨询最新政策。