深圳新生儿医保是否自动扣费取决于具体的缴费方式和绑定账户的情况。以下是详细说明：

1. 自动扣费的条件

• 绑定银行账户：如果新生儿参保登记时绑定了监护人或新生儿本人的银行账户，且账户状态正常、余额充足，医保费用将由税务部门自动从该账户扣除。
• 绑定金融社保卡：如果新生儿办理了金融社保卡并成功激活，医保费用会自动从该卡扣除，而不再使用监护人账户。

2. 扣费时间和流程

• 扣费时间：新生儿医保费用通常在出生后的第四个月开始自动扣除，具体扣费时间可能因季度扣缴安排而有所不同。
• 扣费流程：参保登记成功后，税务部门会根据绑定的账户信息进行扣费。如果新生儿未及时办理户口或登记信息不完善，可能导致扣费失败。

3. 其他缴费方式

如果未绑定银行账户或金融社保卡，监护人还可以通过以下方式自行缴费：

• 微信公众号：关注“深圳税务”微信公众号，进入“我要办”→“社保缴费”模块，完成缴费。
• 支付宝：在支付宝搜索“深圳市税务局”生活号，进入“个人中心”完成缴费。
• 电子税务局：登录“深圳市电子税务局”官网，选择“社保费业务办理”模块进行缴费。
• 线下办理：前往深圳市任一办税服务大厅（第二税务分局除外）办理缴费。

4. 注意事项

• 账户余额：确保绑定的银行账户或金融社保卡有足够余额，以免扣费失败。
• 补缴情况：如果新生儿需要补缴出生月至参保登记月的医保费用，需自行向税务部门申报缴费。
• 非深户宝宝：非深户新生儿需要在户口办理时一并缴纳医保费用。

总结

深圳新生儿医保是否自动扣费取决于是否绑定银行账户或金融社保卡。建议家长在参保登记时仔细核对缴费账户信息，确保扣费顺利进行。如有疑问，可联系当地税务部门或社保机构咨询。