市职工医保和新农合存在以下冲突和注意事项：
一、政策规定层面
- 国家明确规定不得重复参保
根据《中华人民共和国社会保险法》第二十三条，职工应当参加职工基本医疗保险，而新农合（新型农村合作医疗）属于另一种社会保险，两者不能同时参加。
- 社保与商业保险不冲突
新农合与职工医保属于社会保险范畴，与商业医疗保险无直接关联，可同时购买。
二、实际操作层面
- 缴费与待遇享受冲突
若同时缴纳两者，医疗费用只能选择其中一种报销，无法叠加享受。例如住院时只能报销职工医保或新农合中的一种。
- 特殊人群处理方式
-
农村户口进城务工人员 ：可同时缴纳职工医保（单位缴费）和新农合（个人缴费），但报销时只能选择职工医保，已缴新农合费用不予退还。
-
已参加职工医保的农村居民 ：需停缴新农合，否则可能被视为重复参保，已缴费用可能被退回。
三、其他注意事项
- 报销比例差异
职工医保的报销比例普遍高于新农合。例如，职工医保在三级医院的报销比例可达80%以上，而新农合最高仅30%。
- 政策统一趋势
近年来全国大部分地区已实现新农合与城镇居民医保的合并（统称城乡居民医保），未来可能进一步与职工医保整合，但当前仍需分别参保。
- 缴费年限累计计算
若中断职工医保，缴费年限将重新计算，可能影响退休后的养老金待遇。
建议
-
优先选择职工医保 ：其保障范围更广、报销比例更高，尤其适合城市就业人员。
-
避免重复缴费 ：定期核查参保状态，避免因政策调整或信息误差导致重复参保。
-
关注政策动态 ：新型农村合作医疗与城镇居民医保的并轨进展可能影响参保选择。