异地就医备案后医保报销是否设置门槛费，需根据参保地政策及就医类型综合判断，具体说明如下：
一、门槛费的设置情况
- 存在门槛费
多数地区的医保政策对异地就医设置了门槛费，即医疗费用需超过一定金额（如2000元、1500元等）才能开始报销。例如：
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职工医保/个体灵活就业人员 ：每次2000元起付线，报销比例60%；
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城乡居民医保 ：每次2000元起付线，报销比例45%。
- 特殊政策调整
部分城市试点取消门槛费，如乌鲁木齐市城镇职工医保将三级医疗机构首次门槛费90元、再次45元，二级40元、一级20元。
二、报销比例分段标准
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费用区间 ：门槛费以上至3000元报88%，3000-5000元报90%，5000-10000元报92%，10000元以上至最高支付限额内报95%；
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药品及特殊项目 ：乙类药品按80%、贵重药品按70%、特殊检查/治疗按70%报销。
三、备案要求
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备案方式 ：需通过参保地指定渠道办理异地就医备案，备案后持社保卡在异地定点医疗机构直接结算；
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地域限制 ：一次备案仅限一个地区，跨地区就医需重新备案。
四、未备案的后果
若未提前备案，异地就医需先自费，回参保地报销时可能面临“门槛费上浮5%、报销比例下浮5个百分点”的处罚。
总结
异地就医备案后是否收取门槛费，主要取决于参保地政策。建议参保人员提前通过官方渠道确认当地最新规定，避免影响报销。