关于新农合个人医保重复缴费的退费问题，根据搜索结果，可参考以下处理方式：
一、重复参保的退费情形
- 城乡重复参保
若同时参加了新农合和城镇职工医保/城镇居民医保，可保留其中一项，申请终止另一项并退还重复缴费金额。
- 缴费错误导致的重复缴费
因网络故障、系统错误等原因多次扣费，且能提供银行流水等证明材料，可向当地社保机构申请退费。
- 特殊人群政策补贴退费
如五保户、低保户因政策优惠多缴了费用，可申请退还多缴部分。
- 缴费人员去世后的退费
缴费人去世后，其重复缴费部分可申请退还。
二、退费办理流程
- 线上申请
通过当地社保机构官网或官方APP（如12366纳税服务应用）提交退费申请，需提供身份证、缴费凭证、重复缴费证明等材料。
- 线下办理
携带身份证、社保卡、新农合证等材料到当地社保中心或新农合中心窗口办理退费手续。
三、注意事项
- 退费时效
部分地区规定退费需在缴费后15个工作日内办理，逾期可能无法处理。
- 保留参保选择
新农合与社保不可同时参保，需根据自身需求选择保留其中一份，另一份自动终止。
- 特殊情况处理
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多地重复参保需根据参保地政策选择保留地；
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系统错误导致的重复缴费需提供银行流水等证据。
建议办理前咨询当地社保机构，确认具体退费政策和所需材料，避免因政策差异影响退费进度。