南京新生儿医保报销出生费用的方法如下：
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分开报销 ：宝宝出生后发生的医疗费用必须和产妇的费用分开报销，不能混在一起报销。
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直接刷卡结算 ：
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如果新生儿在出生90天后办理参保登记缴费，那么自参保缴费的次月起开始享受医保待遇，出生至参保生效期间的费用需要办理零星报销手续。
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参加过南京准新生儿医保的，出生后医疗费用可以直接报销。
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没参加过南京准新生儿医保的，参保缴费待遇生效后可以直接刷卡结算，出生至参保生效期间的费用需要走零星报销。
- 零星报销 ：
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参保居民在居民医保定点医疗机构发生的医疗费用，属个人自付的，由本人以现金支付给定点医疗机构；属基金支付的，由市医保中心按规定定期与定点医疗机构结算。
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对于出生3个月以内办理参保并足额缴费的新生儿，从出生之日起享受居民医保待遇，其在缴费前发生的医疗费用，都可以事后补报销。
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出生3个月以后办理参保并足额缴费的，从缴费到账之日起享受居民医保待遇。
- 所需材料 ：
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办理新生儿医保需要准备户口簿原件及复印件、《出生证》原件及复印件、《南京市城镇居民基本医疗保险参保缴费申报表》一式两份。
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如需要办理委托银行划账缴费，还需提供市地税部门指定的任一居民医保代征银行的活期个人结算账户、账户持有人身份证原件及复印件一份。
- 参保登记流程 ：
- 参保人（监护人、代理人）可就近到本市各街道（镇）劳动保障服务中心申请办理登记。携带上述资料到就近街道（镇）劳动保障服务中心申请，办理登记后，领取《南京市城镇居民基本医疗保险个人缴费核定单》及《个人基本信息确认表》。登记次月4-23日以选定方式缴纳居民医保费，等待领取医保卡。
- 医保结算报销政策 ：
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报销范围涵盖住院、门诊、门诊紧急抢救、门诊慢性病、门诊特殊检查、门诊特殊病种、门诊特殊药品等费用。
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起付线、报销比例和封顶线根据不同的医疗费用类型和医疗机构级别有所不同，具体标准可以参考相关政策规定。
建议家长在宝宝出生后尽快办理参保登记，以确保能够及时享受医保待遇，减轻家庭的经济负担。