灵活就业人员的医保和社保是否需要分开缴纳，需根据个人就业状态和地区政策判断，具体说明如下：
一、灵活就业人员参保选择
- 医保与社保可分开缴纳
灵活就业人员可根据自身需求选择仅缴纳医保或同时缴纳社保（养老+医疗）。部分地区允许灵活就业人员以“灵活就业”身份单独参保，需向户籍所在地社保机构办理。
- 部分地区强制要求同时缴纳
部分城市（如北京、上海）规定灵活就业人员必须同时缴纳社保和医保，二者不可分割。
二、缴费法律依据与区别
- 社保包含医保
社保中的医疗保险与单独的医保是两个独立险种。灵活就业人员参加职工医保后，无需再单独缴纳医保，但需同时缴纳基本养老保险。
- 缴费主体与待遇差异
单位雇员需由单位统一缴纳五险，而灵活就业人员需自行向社保或医保机构缴费。若仅缴纳医保，将无法享受养老等社保待遇。
三、操作建议
- 咨询当地部门
不同地区政策存在差异，建议通过当地社保或医保部门确认具体缴费要求。
- 选择补充保障
若仅缴纳医保，可考虑购买商业医疗保险作为补充，提升医疗保障。
总结
灵活就业人员医保与社保的缴纳方式因地区而异，部分城市强制要求同时缴纳，部分地区允许分开选择。建议根据自身经济状况和保障需求，结合当地政策做出决策。