上海市在职职工大病医保的报销流程如下：

1. 材料准备 ：

• 《上海市基本医疗保险医疗费拨付申请单》

• 《上海市基本医疗保险转外、急诊登记表》

• 身份证（或市民卡）

• 就诊病历

• 医疗费收据原件

• 费用明细清单（包括治疗、检查费用明细，西药及中成药单价和数量，中草药处方等）

• 出院小结、医疗机构等级证明等其他审核所需的相关资料

2. 提交申请 ：

• 领取并填写《上海市基本医疗保险医疗费拨付申请单》，其中单位参保的须加盖单位公章。

• 持办理材料至市医保经办机构窗口办理。

3. 审核与支付 ：

• 医保部门对提交的材料进行审核。

• 审核通过后，报销款将支付给参保人。支付方式包括“现金支付”和“单位转账”两种方式。现金支付需凭经审核打印并由领导签字的结算单和本人身份证（或市民卡）至财务窗口领取报销款；单位转账则通过财务转账将报销款拨付至所在单位。

4. 其他注意事项 ：

• 报销范围包括恶性肿瘤治疗、精神分裂症治疗等较为重大的疾病。

• 报销比例一般按50%的标准进行。

• 参保人应在医疗费用收据开具之日起的六个月内到本人选定的商业保险机构申请报销大病医疗费用，并提供相应的材料。

• 商业保险机构受理申请后，按照上海市居民大病保险的有关规定对医疗费用进行审核，并在5个工作日内完成申报医疗费用的审核、结算及报销款支付。

建议：

• 确保所有材料齐全且有效，以避免报销过程中出现不必要的延误。

• 了解并确认自己的医保待遇和报销比例，以便更好地规划医疗费用。

• 及时与所在单位或商业保险机构沟通，确保报销流程顺利进行。