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灵活就业人员的医疗保险报销情况如下：
- 参加城镇职工医疗保险 ：
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高档缴费档次 ：建立个人医保账户，报销比例通常在70%到90%之间，具体比例取决于医院级别。例如，三级医院报销约85%，二级医院约90%，一级医院约95%。
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低标准缴费档次 ：不建立个人医保账户，住院报销比例与单位职工相同，但门诊看病和药店买药无法享受报销待遇。
- 参加城乡居民医疗保险 ：
- 住院报销比例一般在50%左右，且门诊看病和药店买药通常不能报销。
- 生育保险 ：
- 一些地方将灵活就业者纳入生育保险范围，可以报销生育费用并享受生育津贴。如果生育期间出现断保情况，可能会影响报销待遇。
- 其他注意事项 ：
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灵活就业人员住院期间需及时向社保机构提供相关医疗费用凭证，并按规定的程序进行报销申请。
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医保报销严格限定在药品、诊疗项目、服务设施三大目录内，非医保目录项目不予报销。
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灵活就业人员未参加生育保险，生育费用无法报销，但符合政策的生育医疗费用可申请一次性定额补助。
综上所述，灵活就业人员在参加城镇职工医疗保险且按高档缴费档次缴费的情况下，住院费用是可以报销的，报销比例较高。参加城乡居民医疗保险的住院报销比例较低。此外，部分地区将灵活就业者纳入生育保险范围，可以报销部分生育费用。建议灵活就业人员根据自身情况选择合适的医保类型，并咨询当地医保部门了解具体的报销政策和程序。