在南京市以灵活就业人员身份参加社保，您有多种缴费方式可以选择，具体如下：
线上缴费
通过“我的南京”APP
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打开“我的南京”APP。
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进入“智慧人社”模块。
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选择“社会保险”下的“征缴与权益记录”。
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点击“灵活就业人员企业职工基本养老保险参保登记”进行参保登记。
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登记完成后，在首页选择“城乡灵活社保缴纳”或“社区—城乡居民和灵活就业人员社保缴费”模块进行缴费。
通过支付宝或微信的“江苏税务社保缴纳”小程序
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打开支付宝或微信。
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进入“江苏税务社保缴纳”小程序。
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选择相应的社会保险进行选档和缴费。
银行缴费
携带有效身份证件到银行柜面
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携带本人有效身份证件。
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前往建设银行、工商银行、邮政储蓄银行、农业银行、南京银行、紫金农商银行、溧水农商行等银行的营业网点。
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在柜面办理养老保险选档缴费，或委托银行按月代扣费款，确保每月25日前将足额费款存入签订有效代扣协议的银行账户。
参保登记
线上办理
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登录江苏人社网上办事服务大厅。
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选择“个人办事”下的“社会保险”再选择“社会保险登记”进行参保登记。
线下办理
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前往各区社保经办机构或街道办理参保登记。
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办理时间为除每月25至28日税务批扣期以外的工作日。
缴费基数和标准
灵活就业人员的养老保险缴费工资基数有十二档，月缴费工资基数和月缴费标准从4879元到24396元不等，您可以根据个人经济状况自主向税务部门申报选档缴费。
注意事项
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线上缴费渠道在每日20:30至次日7:00系统维护，在此期间无法缴费，请合理安排缴费时间。
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绑定银行代扣缴费的灵活就业人员应确保在每月26日至月底期间缴费卡内有足够的钱用于扣款。
以上就是南京市灵活就业人员缴纳社保的方法，您可以根据自己的情况选择最适合的缴费渠道。