安徽医保跨市住院的报销比例根据具体情况有所不同，主要包括以下几点：
- 一般情况下的报销比例 ：
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职工医保：报销比例为90%（在职）。
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居民医保：报销比例为60%。
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新农合：报销比例为75%。
- 异地就医的报销比例 ：
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异地就医的报销条件包括已办理异地安置、探亲、驻外工作学习等外地就医登记备案手续的参保人员，在异地医保定点医疗机构发生的医疗费用垫付现金的情形。
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省级参保人员经备案同意转北京、上海医保定点医疗机构就医发生的医疗费用垫付现金的情形。
- 起付线和报销比例 ：
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省内跨市就医住院治疗的，起付线增加1倍，基金支付比例降低5个百分点。
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跨省就医起付线按照当次住院总费用的20%计算，不足2000元的按照2000元计算，最高不超过1万元，报销比例为60%；未办理转诊手续的报销比例为50%。
- 转诊异地就医的报销比例 ：
- 以合肥地区为例，省内异地住院待遇提高，异地转诊转院人员和异地急诊抢救人员省内住院报销由降点10%变为降点5%，其他临时外出就医人员省内住院报销由降点20%变为降点15%。
- 具体费用报销比例 ：
- 报销比例按照具体费用来认定，3000元以下的按照88%报销，3000至5000元的按照90%报销，5000至10000元的按照92%报销，10000元以上的至最高支付限额内的按照95%报销。乙类药品按80%，贵重药品按70%，特殊检查和特殊治疗的按70%报销。
安徽医保跨市住院的报销比例存在多种情况，具体报销比例需要根据患者的医保类型、就医地、是否办理转诊手续等因素来确定。建议患者在异地就医前，详细了解当地医保政策，以确保能够享受到应有的医保待遇。