灵活就业医保的交费方式有以下几种：
- 电子税务局APP ：
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登录“电子税务局”APP，进入首页“点击进入社保费”模块，点击“社保费缴费办理（选档）”。
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核对本人身份信息，确认无误后点击“下一步”；勾选“企业职工基本养老保险费”并核对缴费基数等基本信息，核实无误后，点击“下一步”。
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勾选对应的费款所属期并核实费额，确认无误后点击“提交”；点击“确认缴费”后拉起第三方支付软件，完成缴费。
- 微信 ：
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进入【我的】页面，进入【服务】。
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点击【城市服务】。
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再点【社保】。
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直接找到【灵活就业人员医保参保登记】，如果在支付宝登记过了，不需要重复登记。
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然后再进入【灵活就业医疗保险缴纳】去缴费。
- 支付宝 ：
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打开首页进入【市民中心】。
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点击【社保】。
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进去后往拉下找到【灵活就业人员参保登记】。
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进去之后填写自己的信息登记一下，这是参保之前必做的一个登记，否则后边无法缴费。
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然后退回【社保】页面找到【社保缴费】，会跳转到你所在地的参保界面，然后填写你的信息，选择缴费的险种。
- 其他渠道 ：
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通过“福建税务”App、“福建税务”微信公众号，以及“闽政通”等各地政务App、第三方支付平台（如，支付宝、微信、云闪付）、合作商业银行、办税服务厅、自助办税终端等渠道进行缴费。
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通过微信公众号、云闪付APP、参保地各办税服务厅自助终端、办税服务厅窗口进行缴费。
建议选择一种自己最方便的方式进行缴费，如经常使用微信或支付宝，则可以通过这两个平台进行操作。