灵活就业医保在手机上缴费的方法如下：
- 通过支付宝缴费 ：
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打开支付宝APP，搜索“闽政通”或直接打开“闽政通”小程序。
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在首页选择“闽捷办”，进入服务页面后，点击“个人参保缴费服务”。
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在“我要缴费”版块选择“个人社（医）保缴费办理”，核对并确认个人信息后点击“下一步”。
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在“参保信息选择”界面，勾选险种基本医疗保险费，确认好缴费基数后点击“下一步”，进入“缴费信息提交”界面选择“日常缴费”。注意选择页面上方的费款所属期，若缴费信息无误，点击“提交”进行缴费即可。
- 通过微信缴费 ：
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关注“福建税务”公众号。
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进入公众号后，点击【微办税】——【医保社保业务】。
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点击【个人社 （医） 保缴费办理】进入【个人信息填写】界面，选择“证件类型”并录入证件号码和姓名，点击【确定】。
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系统自动带出对应参保登记信息，核对无误后点击【下一步】。
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在【参保信息选择】界面，勾选险种【基本医疗保险费】，确认缴费基数后点击【下一步】。
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在【缴费信息提交】界面，选择【日常缴费】，确认缴费信息无误后点击【提交】，选择支付方式完成缴费。
- 通过其他APP缴费 ：
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下载并安装相关社保缴费APP，如“交医保”等。
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注册账号并登录，选择参保缴费选项。
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填写个人信息，选择居民医保缴费，选择缴费对象，点击缴费，核对信息后完成缴费。
建议选择一种自己最方便的方式进行缴费，确保按时缴纳医保费用，以保障自己的医疗保障权益。