农村合作医疗的报销比例根据就诊机构的不同而有所差异。具体报销比例如下：
- 门诊补偿 ：
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在村卫生室及村中心卫生室就诊，医疗费用可报销60%。
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在乡卫生院就诊，医疗费用可报销40%。
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在二级医院就诊，医疗费用可报销30%。
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在三级医院就诊，医疗费用可报销20%。
- 住院报销 ：
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在乡卫生院住院，医疗费用可报销60%。
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在二级医院住院，医疗费用可报销40%。
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在三级医院住院，医疗费用可报销30%。
- 大病补偿 ：
- 对于参加新农合的住院病人，若一次性或全年累计的医疗费用超过5000元，将分段进行赔偿。具体而言，5001元至1万元的部分可补偿65%，10001元至1.8万元的部分可补偿70%。
根据以上信息，如果住院医疗费用为16000元，并且符合大病补偿的条件，那么报销情况如下：
- 住院费用报销 ：
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5001元至10000元的部分报销65%，即（10000 - 5000） × 65% = 5000元。
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10001元至16000元的部分报销70%，即（16000 - 10000） × 70% = 4200元。
- 大病补偿 ：
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5001元至10000元的部分已报销5000元。
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10001元至16000元的部分可报销4200元。
总报销金额为5000元（住院费用） + 4200元（大病补偿） = 9200元。
建议：
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确保了解当地的具体政策和报销流程，因为不同地区的政策可能有所不同。
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保留好所有相关的医疗费用单据和证明材料，以便在报销时能够顺利进行。