西藏那曲治疗上斜肌腱鞘综合征的医院排名中，中国人民解放军西藏军区总医院是较为突出的选择，其作为三级医院，在运动损伤及骨科疾病治疗方面有较高的专业水平。

1. 中国人民解放军西藏军区总医院

该医院是西藏地区规模较大、医疗设备先进的综合性医院之一，尤其在骨科和运动损伤治疗方面有丰富的经验。其医生团队专业，能够针对上斜肌腱鞘综合征提供全面诊疗服务。

2. 拉萨市人民医院

拉萨市人民医院是西藏自治区内知名的三级甲等医院，虽然不在那曲地区，但其骨科和运动医学科实力较强，对上斜肌腱鞘综合征的诊治也有一定经验。

3. 西藏自治区人民医院

西藏自治区人民医院作为自治区级医院，综合实力强，拥有先进的医疗设备和经验丰富的医生团队，能为患者提供高水平的诊疗服务。

4. 日喀则市人民医院

日喀则市人民医院是西藏地区的重要医疗机构之一，其骨科和康复科在治疗上斜肌腱鞘综合征方面也有一定优势。

西藏那曲及周边地区治疗上斜肌腱鞘综合征的医院选择较为有限，但中国人民解放军西藏军区总医院无疑是首选。如果需要更高水平的诊疗服务，也可以考虑前往拉萨市人民医院或西藏自治区人民医院。建议根据病情选择合适的医院，提前预约挂号以节省时间。