吉林省新农合参保人员在北京市就医并申请报销时，可以按照以下步骤进行操作：

1. 异地就医备案

• 备案方式：根据吉林省医疗保障局发布的《吉林省医疗保险异地就医管理办法》，参保人员需提前在参保地医保经办机构进行备案。备案可通过线上或线下方式完成。
• 所需材料：一般包括身份证、新农合医疗证或社会保障卡，以及转诊证明（如需转诊）。
• 备案目的：备案成功后，参保人员在北京市的定点医院可以直接结算，无需全额垫付医疗费用后再回参保地报销。

2. 就医流程

• 定点医院选择：参保人员需选择北京市已开通异地就医直接结算服务的定点医院。
• 就医登记：在住院登记时，主动出示社会保障卡（医保卡）。这是异地直接结算的唯一身份识别凭证。
• 注意事项：若未携带医保卡或未完成备案，可能需要全额垫付医疗费用，再回参保地手工报销。

3. 报销方式

• 直接结算：备案成功后，参保人员在北京市定点医院可直接使用医保结算，报销部分费用由医院直接扣除。
• 手工报销：如果未完成备案或无法直接结算，需全额支付医疗费用，并携带以下材料回参保地医保经办机构报销：
  • 身份证、新农合医疗证或社会保障卡；
  • 医疗费用发票、费用清单；
  • 住院病历或相关证明材料。

4. 注意事项

• 转诊要求：部分疾病可能需要参保地开具转诊证明才能享受报销待遇，建议提前咨询参保地医保部门。
• 急诊情况：如因突发疾病需要急诊治疗，可直接就医，后续联系参保地医保部门了解报销政策。
• 政策差异：异地就医报销政策可能因地区或时间有所调整，建议拨打12333医保服务热线咨询最新政策。

5. 咨询渠道

• 吉林省医保部门：可拨打吉林省医保服务热线或联系参保地医保经办机构，了解具体备案流程和报销政策。
• 北京市医保部门：如需了解北京市定点医院或直接结算政策，可拨打北京市医保服务热线咨询。

通过以上步骤，吉林省新农合参保人员在北京就医并报销将更加顺畅。如有其他疑问，建议及时联系医保部门获取最新信息。