住院合疗报销需要以下手续和材料：
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住院证明 ：住院后，县农村合作医疗社需要开具一个住院证明用于登记备案。
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病案资料 ：住院完后，需要到医院档案室复印以下资料：
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病人住院病案首页
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入院记录/住院志
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出院小结/出院记录
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化验结果（粘贴单）
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辅助检查结果
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临时医嘱
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长期医嘱
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辅助检查医嘱
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化验单
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费用清单 ：准备费用总清单和收费收据。
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个人证件 ：
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合作医疗证
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身份证
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户口本原件
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疾病诊断证明
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出院小结
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电脑住院发票原件
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总费用清单
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转诊证明 （如适用）：如果转诊到市外定点医疗机构住院，还需补充转诊证明等资料
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特殊病种证明 （如适用）：对于特殊病种，需提供特殊病种门诊治疗建议书、相关化验报告单等
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其他相关资料 ：根据具体情况，可能还需要提供其他相关资料，如外伤证明、出生证明、准生证等
报销流程
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入院时 ：提交上述所有材料给医院新农合窗口进行审核和登记。
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出院时 ：办理出院手续，并向医院索取住院发票。
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报销时 ：携带所有材料前往当地的新农合经办机构办理报销手续。
注意事项
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确保所有材料齐全且有效。
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报销比例和金额根据当地政策和个人缴费情况有所不同。
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异地住院的报销可能需要额外的转诊证明和手续。
建议提前咨询当地新农合经办机构，了解具体的报销流程和所需材料，以确保报销过程顺利。