农村合作医疗报销流程如下：

1. 市内定点医疗机构就诊 ：

• 直接在窗口刷卡报销。

2. 市外2级及以上公立医院就诊 ：

• 出院后3个月内，携带就医资料（包括身份证、户口簿、住院发票、出院小结、费用清单等）前往区服务中心报销。

3. 审核通过后 ：

• 报销费用会打到指定的银行账户中。

4. 提供资料到医保办 ：

• 个人资料（身份证或户口簿）原件、复印件、住院诊断证明、住院收费收据（发票）、医疗费用清单。外伤还需提供情况证明书、入院首次病案记录（住院病案首页）。

5. 确认参保身份和登记信息 ：

• 到医保办确认参保身份和登记信息。

6. 资料审核录入系统结算 ：

• 医保办对报送的资料审核录入系统结算。

7. 核发银行账户 ：

• 财政所核发参保人提供的银行账号。

8. 门诊补偿 ：

• 携带报销联处方、结算单、合作医疗证号等材料到乡镇农医所申请报销所垫资金。

9. 住院报销 ：

• 携带医药发票、出院小结、各种检查单、处方复写件等材料到本乡镇农医所申请报销。

10. 费用核算 ：

• 县级定点医疗机构和乡镇定点医疗机构分别进行费用核算，并填写《新型农村合作医疗住院补偿表》。

11. 费用兑付 ：

• 由县级以下定点医疗机构合作医疗窗口兑付人员根据审核意见，向申请人支付应当报销的医药费用。

建议：

• 尽量在出院后及时办理报销手续，以免影响费用报销。

• 保持所有报销材料的完整和清晰，以便顺利通过审核。

• 如有特殊情况或需要额外证明，及时咨询当地医保办或相关部门。