上海咽喉科最好的医院有以下几家：
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复旦大学附属眼耳鼻喉科医院 ：这是一家在耳鼻喉科领域具有极高声誉的医院，拥有强大的医疗团队和先进的医疗设备。它在复旦版医院专科榜中耳鼻喉科排名第一，并且是全球规模最大的耳鼻咽喉头颈外科疾病诊疗和科研中心之一。
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上海交通大学医学院附属第九人民医院 ：这所医院在耳鼻喉科领域也有很高的声誉，其耳鼻喉科在复旦版医院专科榜中也有很高的排名。
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上海第六人民医院 ：这所医院的耳鼻喉科同样在复旦版医院专科榜中名列前茅。
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上海虹桥医院 ：这所医院的耳鼻喉科在治疗急性喉炎等常见呼吸道疾病方面有良好的效果。
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上海耳鼻喉科医院 ：这所医院在耳鼻喉科领域也有较高的声誉，并且有多个分院。
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武警上海总队医院 ：这所医院的耳鼻喉科在鼻炎、鼻窦炎、咽喉炎、耳聋、中耳炎、鼾症等疾病的治疗方面取得了显著成果。
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上海市第一人民医院 ：这所医院作为一所三级甲等综合性医院，其耳鼻喉科专科在业界享有盛名。
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上海德馨医院 ：这所医院的耳鼻咽喉科是医院重点科室，并且是上海市医保定点医疗机构。
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上海江城医院五官科医院 ：这所医院在治疗鼻炎等耳鼻咽喉科疾病方面有良好的声誉。
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上海解放军八五医院 ：这所医院作为三甲医院，其耳鼻喉科也是一个不错的选择。
综合考虑各医院的声誉、医疗设备和专业团队， 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院 和 上海交通大学医学院附属第九人民医院 在耳鼻喉科领域具有最高的声誉和实力，是患者选择的最佳医院。当然，具体选择哪家医院还需根据患者的具体病情和需求来决定。