居民医保和合作医疗的主要区别如下：
- 服务对象不同 ：
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居民医保主要面向老人、儿童、在校学生、其他未成年人等。
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合作医疗主要面向农村居民、城镇居民、少年儿童、学生、老年人等。
- 缴纳金额不同 ：
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居民医保由个人缴费和政府补助构成，可以按年缴费，也可以一次性缴纳。
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合作医疗只缴纳个人费用，没有政府补助。
- 报销比例不同 ：
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居民医保一般按梯次报销，根据医院等级不同，报销比例也不同，且在普通门诊、门诊慢特病和大病保险方面都有相应的保障。
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合作医疗报销比例一般在60%到80%之间，且在大病保障方面，实际报销比例最高可达90%。
- 缴纳费用方式不同 ：
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居民医保由个人缴费和政府补助构成。
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合作医疗由个人缴费和集体补助构成，没有政府补助。
- 保障待遇的侧重点不同 ：
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居民医保更侧重于体现互济性，即将分散的小钱集中起来治大病，建立了特定门诊慢性病和普通门诊慢性病报销制度。
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新农合则更侧重于普惠制，个人虽然报销额度不多，但人人有份，且在普通门诊统筹方面，报销比例较高。
- 管理部门不同 ：
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城镇居民医保主要由人社部门管理。
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新农合多数地方由卫生部门管理。
居民医保和合作医疗在服务对象、缴纳金额、报销比例、缴纳费用方式、保障待遇的侧重点以及管理部门等方面存在明显差异。建议根据个人户籍和实际需求选择合适的医保类型。