农村合作医疗（简称新农合）与社保（即城镇职工社会保险）在多个方面存在显著差异：
- 概念与性质 ：
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社保 ：包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险，是五险之一。狭义的社保主要指城镇职工社会保险，广义的社保则包括所有社保制度。
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农村合作医疗 ：简称新农合，现已与城镇居民医疗保险合并，统称城乡居民医疗保险。它是一种针对农村居民的社会保险制度。
- 参保人群 ：
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社保 ：主要针对有正式工作的城镇职工，由职工和用人单位共同缴纳。
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农村合作医疗 ：主要面向农民，只有农村户口的人员才能办理。
- 缴费方式与费用 ：
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社保 ：缴费较高，最低缴费一年要千元以上，且由职工和用人单位共同缴纳。
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农村合作医疗 ：缴费相对便宜，一年缴费金额大概在两百元左右，由个人自愿参加，一年一交费。
- 保障期限 ：
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社保 ：医疗保险参保人员完成缴费年限后可以终身享受医保待遇。
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农村合作医疗 ：交一年保一年，不续交则不再享受待遇。
- 报销比例与待遇 ：
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社保 ：报销比例较高，尤其是在城镇职工医保政策范围内，住院费用报销比例可达80%以上。
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农村合作医疗 ：报销比例较低，且一般只能针对医疗保险进行报销。
- 管理与使用 ：
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社保 ：由社保系统管理，参保人员可以在各个区域方便地进行报销，跨区域看病需先备案。
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农村合作医疗 ：由卫生局管理，个人缴费部分可在本县区基层医疗机构使用，但无法像社保卡一样随时刷卡。
- 同时报销问题 ：
- 社保和新农合 ：不可以同时报销。一般来说，社保的报销比例和总额度都比农村合作医疗高，因此建议优先使用社保，剩余部分如果新农合参保地同意，还可以得到一些报销。
农村合作医疗和社保在概念、参保人群、缴费方式、保障期限、报销比例、管理与使用以及同时报销方面均存在明显差异。它们不是一样的。