在工厂上班交了社保后，新农合的处理方式如下：
- 优先选择职工社保 ：
- 由于职工社保（包括医疗保险）的报销比例和范围通常比新农合更高，建议优先选择参加职工社保。
- 退还新农合费用 ：
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如果你已经参加了职工社保，那么之前缴纳的新农合费用是可以退还的。你需要提供职工社保的缴费明细和缴费证明，然后要求退还新农合的费用。
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新农合的费用是不能退还的，因为即使你没有享受到医保的报销待遇，也会视同于你享受了医保的报销待遇。
- 合并养老保险 ：
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如果你在户籍地办理的新农合，去外地可以继续购买社保，但养老金只算其一。因为退休前两地养老保险账户要合并，要办理其中一个养老保险的重复缴费退费。
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社保的养老保险可以将金额与缴纳年限一起转移到城镇居民养老保险中，但缴纳年限无法转移。
- 停止缴纳新农合 ：
- 交社保后，建议停止缴纳新农合，以避免重复报销和冲突。如果你担心辞职后无法继续缴纳社保，也可以选择重新参加新农合，但要注意不要错过缴费时间。
- 咨询当地政策 ：
- 具体的退还时间和流程可能因地区而异，建议咨询当地社保部门或医保机构，了解最新的政策和规定。
综上所述，如果你已经在工厂上班并交了社保，建议优先选择参加职工社保，并退还新农合的费用。同时，了解并遵循当地的政策，确保养老保险和医疗保险的顺利过渡和合并。