城乡合作医疗和职工医保的主要区别体现在以下几个方面：
- 面对人群不同 ：
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职工医保 ：主要面向有工作单位或从事个体经济的在职职工和退休人员。
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城乡居民医保 ：主要面向具有城镇户籍的没有工作的老年居民、低保对象、重度残疾人、学生儿童及其他城镇非从业人员。
- 缴费标准及来源不同 ：
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职工医保 ：由用人单位和职工个人共同缴纳，不享受政府补贴。
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城乡居民医保 ：缴费标准总体上低于职工医保，在个人缴费基础上政府给予适当补贴。
- 待遇标准不同 ：
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职工医保 ：由于筹资水平较高，医疗待遇标准总体上略高于城乡居民医保。
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城乡居民医保 ：由于筹资水平较低，医疗待遇标准总体上略低于职工医保。
- 缴费要求不同 ：
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职工医保 ：设立最低缴费年限，达到缴费年限（男25年、女20年）的，退休后不再缴费即可享受基本医疗保险待遇。
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城乡居民医保 ：不设立最低缴费年限，必须每年缴费，不缴费不享受待遇。
- 报销范围和比例不同 ：
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职工医保 ：报销范围包括门诊、住院和买药，报销比例一般70%-90%之间，起付线较高。
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城乡居民医保 ：一般报销住院医疗费，报销比例一般50%-70%之间，起付线较低。
- 医保账户不同 ：
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职工医保 ：有个人账户，职工个人缴纳的基本医疗保险费可计入个人账户，在享受住院、门诊费用结算报销待遇个人负担部分的费用可通过个人账户进行支付。
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城乡居民医保 ：没有医保个人账户，参保人在缴纳医保后可持医保凭证（医保电子凭证/社会保障卡）就医，享受住院、门诊费用结算报销。
职工医保和城乡居民医保在参保对象、缴费标准、待遇标准、缴费要求、报销范围和比例以及医保账户等方面存在明显差异。建议根据自身情况选择合适的医保类型进行参保。