农村合作医疗（新农合）和医保（城镇职工基本医疗保险）之间存在明显的区别，主要体现在以下几个方面：
- 缴费主体不同 ：
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医保是城镇职工缴纳的，费用由职工和单位共同承担，单位缴纳的比例较高。
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农村合作医疗是农民自愿参加的，费用一般由农民自己承担。
- 覆盖对象不同 ：
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医保主要覆盖城镇职工、城镇居民以及乡镇企业从业人员等。
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农村合作医疗仅覆盖农村户口居民，且通常以家庭为单位整户参加。
- 缴费方式不同 ：
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医保的缴费是单位和个人一起缴纳，且单位缴纳的比例较大。
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农村合作医疗的缴费是农民个人每年自愿缴纳固定金额，政府可能会提供一定的补贴。
- 待遇不同 ：
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医保的报销比例和范围较广，包括特殊治疗方法、进口药和高档医疗服务。
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农村合作医疗的报销比例相对较低，且报销范围有限，一些大医院门诊和特殊药品可能不在报销范围内。
- 有无个人医保账户 ：
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医保有个人医保账户，可以用于门诊和住院费用的支付。
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农村合作医疗没有个人医保账户。
- 期限和保障不同 ：
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医保要求持续缴纳一定年限（如15年）后，可以享受终身医保待遇。
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农村合作医疗通常是交一年保一年，缺乏长期保障。
农村合作医疗和医保在缴费主体、覆盖对象、缴费方式、待遇、有无个人医保账户以及期限和保障等方面均有显著差异。建议根据自身情况选择合适的医疗保障方式，以确保获得适当的医疗保障。