农村合作医疗的网上停保流程如下：
- 通过微信停保 ：
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打开手机上的微信，点击“我”。
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点击“支付选项”进入。
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找到“生活缴费”并点击进入。
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在页面右侧点击“下箭头”进入。
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切换到自己的城市，点击“社保医保”进入。
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选择“医疗保险”，输入身份证号，勾选“同意服务协议”。
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点击“停止缴费信息”，进行停止即可。
- 通过官方APP停保 ：
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下载并登录国家医保服务平台APP。
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点击“地方网厅”选择您的医保所在地区。
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进入地区医保服务大厅后，点击“个人登录”。
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如没有账号，请点击右上角“注册”并进行认证。
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登录完成后，点击左侧菜单栏“我要办”。
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选择“城乡居民暂停参保”，根据个人情况选择相应的“暂停原因”，点击“提交”，等待工作人员审核。
- 通过当地社保中心电话停保 ：
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在上班时间拨打12333社保中心电话咨询怎么取消。
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或者拨打新农合医疗本上的咨询电话咨询。
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上班时间去当地社保中心咨询。
建议您根据个人习惯和方便性选择上述方法中的一种进行操作。如果所在地区支持通过微信办理服务，那么微信停保的方法可能更为便捷。如果不习惯使用微信或APP，也可以选择通过电话或直接到当地社保中心咨询停保事宜。