特殊门诊能定点的医院数量因地区政策不同而有所差异，以下是部分地区的政策规定：
江苏省盐城市
盐城市职工医保门诊慢特病相关治疗费用跨省直接结算政策规定，对于门诊慢特病不限制定点医院数量，参保人员可以在北京选择任何一家已开通高血压门诊慢特病费用跨省联网定点医疗机构就诊，并享受直接结算服务。
部分地区
部分地区规定参保人办理门特病种资格认证手续的医院将默认成为参保患者选定的就诊备案医疗机构，参保人还可根据自身需要，在提供门特病种服务的定点医疗机构中再选择2家办理就诊备案手续。享受II类门特病种待遇的参保人，另可再选定3家定点零售药店办理处方外配备案手续。
乌海市
自2024年9月1日起，乌海市取消了职工、城乡居民基本医疗保险特殊病种门诊慢性病就医定点医疗机构数量限制。
莆田市
自2024年10月1日起，莆田市取消了职工和城乡居民基本医疗保险门诊特殊病种就医定点医疗机构数量限制，参保人员可根据病情需要在具有资质的医保定点医疗机构就诊。
泉州市
在市内就医的，不受门诊特殊病种就医定点医疗机构数量限定；在市外就医的，每个病种只能指定1-2家定点医疗机构，原则上一年内不得变更指定医疗机构。
雅安市
特殊门诊最多可以申请五个病种，可申请两个（家）定点医院作为门诊特殊疾病治疗机构。