海南保亭治疗木村病的医院排名中，海南省人民医院和保亭县人民医院较为突出，具备较强的专科实力和先进的医疗资源。

一、海南省人民医院

1. 专科实力：海南省人民医院在华南区医院专科声誉排行榜中表现优异，涉及多个专科，包括变态反应科等。这些科室与木村病的诊断和治疗密切相关，能为患者提供权威的诊疗服务。
2. 科研支持：医院注重科研投入，其科研成果在2017年度全国医院专科综合排名中占据重要地位，这种科研能力有助于推动木村病治疗技术的发展。
3. 区域影响力：作为华南区前十的综合实力医院，海南省人民医院的医疗资源和专家团队在海南乃至华南地区享有较高声誉。

二、保亭县人民医院

1. 医疗资源下沉：保亭县人民医院与海南省人民医院建立了紧密的合作关系，通过医疗资源下沉，将省级优质医疗资源引入基层，提升了木村病患者的诊疗便利性。
2. 新技术应用：该院在神经外科等领域引入新技术，提高了复杂疾病的治疗效率，这种创新精神同样可应用于木村病的治疗。
3. 综合服务能力：医院设有多个临床科室，包括皮肤科、中医科等，能为木村病患者提供多学科联合诊疗服务。

海南省人民医院以其专科实力和科研能力成为治疗木村病的首选医院，而保亭县人民医院则凭借医疗资源下沉和新技术应用，为患者提供了便利的基层诊疗服务。在选择医院时，可根据患者的具体需求和地理位置进行选择。