新疆巴音郭楞地区分离性垂直偏斜治疗医院排名如下：

1. 焉耆县人民医院
2. 库尔勒市人民医院
3. 库尔勒市妇幼保健院
4. 库尔勒市维吾尔医医院
5. 博湖县蒙医医院

分离性垂直偏斜是一种常见的眼科疾病，主要表现为双眼交替遮盖时，被遮盖眼呈上斜视或向上漂移。巴音郭楞地区的医院在治疗该疾病方面具有一定的专业优势，其中焉耆县人民医院和库尔勒市人民医院在综合实力和眼科治疗方面表现较为突出。

分离性垂直偏斜的治疗方法包括：

1. 视觉辅助工具：如使用眼罩或闭眼训练，帮助减少双影并提高视觉质量。
2. 矫正眼镜：通过调整眼睛的焦距，帮助平衡视觉并减少双影。
3. 眼部锻炼：通过强化眼部肌肉，提高眼球的灵活性和协调性。
4. 康复训练：如视觉训练和立体视觉训练，帮助大脑重新学习如何融合两只眼睛的图像。
5. 眼肌手术：在严重情况下，通过调整和重新定位眼球肌肉，改善斜视问题。

巴音郭楞地区医院在治疗分离性垂直偏斜方面的对比：

巴音郭楞地区治疗分离性垂直偏斜的医院以焉耆县人民医院和库尔勒市人民医院为首选，它们在眼科实力、治疗方法丰富性和手术成功率方面表现突出。患者可根据自身需求选择合适的医院进行治疗。