目前并没有一个绝对权威的甲状腺消融术医院排名，但根据医院的综合实力、甲状腺疾病的治疗水平、专家团队、设备先进程度等因素，以下是一些在甲状腺消融术方面比较知名的医院：
北京地区
北京协和医院：北京协和医院的普通外科在甲状腺疾病诊治方面经验丰富，拥有一支高素质的医疗团队，多名专家在中华医学会和国内外杂志担任领导职务，能够为患者提供专业的诊疗服务。
中国人民解放军总医院：该院综合外科在甲状腺等普通外科疾病的诊治上具有丰富的临床经验，能够为患者提供全面的医疗服务。
北京301医院：北京301医院的介入超声科在甲状腺消融术方面技术成熟，梁萍、于晓玲等主任在该领域享有较高声誉。
上海地区
上海交通大学医学院附属瑞金医院：瑞金医院的甲状腺血管外科擅长诊治甲状腺血管外科常见病、多发病、疑难病，在甲状腺疾病的治疗上具有显著优势。
江西地区
南昌市第五医院：南昌市第五医院甲状腺科在甲状腺疾病的治疗方面具有一定的特色和优势，能够为患者提供专业的诊疗服务。
广东地区
广州复大肿瘤医院：广州复大肿瘤医院在甲状腺结节的微波消融术方面有成功案例，能够为患者提供有效的治疗方案。
四川地区
四川大学华西医院：华西医院的甲状腺外科在晚期甲状腺癌的手术治疗等方面处于国际、国内领先水平，承担多项国家级和省部级科研课题，发表论文百余篇。
山西地区
太原博润甲状腺医院：太原博润甲状腺医院是山西甲状腺微波消融技术的领航者，汇聚国内顶尖甲状腺专家，为患者提供专业的诊疗服务。
浙江地区
浙江大学医学院附属第一医院：浙大一院的甲状腺外科业务范围包括甲状腺癌、结节性甲状腺肿、甲状腺腺瘤、甲亢、甲状旁腺疾病等的综合治疗。
湖南地区
中南大学湘雅二医院：湘雅二医院的代谢内分泌学科在复旦专科榜全国排名靠前，医院综合实力强，在甲状腺疾病的治疗方面也有较高的水平。