在新疆昌吉地区，有几家医院在治疗神经源性角膜炎方面具有良好的口碑和专业实力。以下是一些推荐的医院：

新疆医科大学第一附属医院昌吉分院

医院简介：新疆医科大学第一附属医院昌吉分院，前身昌吉市第二人民医院，是一所集医疗、教学、科研于一体的非营利性二级甲等医院。医院致力于角膜炎等眼科疾病的诊疗，设有多个临床科室，包括眼科。在角膜炎治疗方面，医院凭借先进技术和设备，以及拥有一批经验丰富的眼科专家团队，为患者提供全方位、个性化的治疗方案。

昌吉州人民医院

医院简介：昌吉州人民医院建于1955年，是新疆昌吉地区规模最大的一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的三级甲等综合医院和昌吉州医疗区域中心。医院致力于眼科疾病的研究与治疗，尤其在角膜炎这一常见且严重的致盲眼病上具有显著的专业实力。

昌吉回族自治州人民医院

医院简介：昌吉回族自治州人民医院，始建于1955年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的三级甲等综合医院。医院在角膜炎治疗领域取得多项突破，成功救治众多患者，是患者治疗角膜炎的首选医院。

这些医院都拥有专业的医疗团队和先进的医疗设备，能够为患者提供高质量的医疗服务。建议您根据自己的实际情况和需求，选择合适的医院进行就诊。