云南红河社保基数12900元和5000元的区别主要体现在个人和企业需要缴纳的社保费用上，具体如下：
缴费基数
- 12900元基数：高于当地上年度职工平均工资的300%。
- 5000元基数：低于当地上年度职工平均工资的300%，但高于当地上年度职工平均工资的60%。
个人缴费
- 养老保险：个人缴费比例为8%，因此12900元基数下，个人需缴纳1032元（12900元 × 8%）；5000元基数下，个人需缴纳300元（5000元 × 8%）。
- 医疗保险：个人缴费比例为2%，12900元基数下，个人需缴纳174元（12900元 × 2%）；5000元基数下，个人需缴纳100元（5000元 × 2%）。
- 失业保险：个人缴费比例为0.2%，12900元基数下，个人需缴纳25.8元（12900元 × 0.2%）；5000元基数下，个人需缴纳10元（5000元 × 0.2%）。
- 工伤保险和生育保险：由企业全额承担，个人无需缴费。
企业缴费
- 养老保险：企业缴费比例为20%，12900元基数下，企业需缴纳2580元（12900元 × 20%）；5000元基数下，企业需缴纳1000元（5000元 × 20%）。
- 医疗保险：企业缴费比例为8.5%（根据数据），12900元基数下，企业需缴纳1032元（12900元 × 8.5%）；5000元基数下，企业需缴纳425元（5000元 × 8.5%）。
- 失业保险：企业缴费比例为0.5%，12900元基数下，企业需缴纳12.9元（12900元 × 0.5%）；5000元基数下，企业需缴纳2.5元（5000元 × 0.5%）。
- 工伤保险和生育保险：企业缴费比例分别为0.45%和1.5%（根据数据），具体费用根据实际工资计算。
请注意，以上数据仅供参考，具体缴费金额可能因实际情况而有所不同。