海南文昌治疗基质性角膜炎推荐选择文昌市人民医院（三甲综合医院）或文昌视康眼科医院（专科医院）。前者是当地综合实力最强的公立医院，拥有角膜科专家团队和三级诊疗资源；后者作为文昌首家眼病专科医院，与省级眼科中心联合，可提供更垂直的诊疗服务。
文昌市人民医院：作为三甲综合医院，其眼科由吴芳（擅长角膜盲、干眼症等）和庄耿刚（擅长翼状胬肉、白内障等手术）等专家坐诊，依托同济医院托管背景，设备和技术达到省内先进水平，适合复杂病例或需多学科协作的患者。
文昌视康眼科医院：专科优势突出，与中山大学中山眼科中心协作，定期有省级专家坐诊，36张病床专注眼病治疗，对基质性角膜炎的检查、用药和手术更具针对性，尤其适合长期随访或行动不便的老年患者。
其他选择：若病情复杂或需更高阶治疗，可考虑海口的三甲医院如海南省人民医院（眼底病专家杨洁等）、海南医学院第一附属医院，车程约1.5小时，但需提前预约。
建议根据病情急缓、经济预算和复诊便利性综合选择，初诊可优先考虑本地医院，疑难情况再转诊至海口。