不同地区和不同类型的医保政策对于合作医疗在三甲医院门诊报销的起付线有不同的规定，以下是部分地区的具体政策：
江苏省苏州市
职工医保：三级医疗机构起付标准为400元，在职职工报销55%，退休职工报销60%。
居民医保：三级医疗机构成年人起付标准为700元，报销比例为50%。
湖南省长沙市
新农合：普通门诊医药费补偿不设起付线，每人每年补偿限额为100元。
大额门诊医疗费用：起付线为2000元，超过起付线门诊医药费用按照25%予以补偿，全年累计补偿限额为1500元。
辽宁省大连市
职工医保：特殊三级医疗机构起付标准为600元，在职职工报销50%，退休职工报销55%；其他三级医疗机构起付标准为400元，在职职工报销55%，退休职工报销60%。
居民医保：特殊三级医疗机构成年人起付标准为1000元，报销比例为50%。
河南省
新农合：普通门诊报销不设起付线，报销比例为55%，每人每日不超过40元，年度补偿额不足100元，余下部分会累计下一年使用。
大额门诊医疗费用：起付线为2000元，超过起付线门诊医药费用按照25%予以补偿，全年累计补偿限额为1500元。
北京市
新农合：三级医院门诊报销比例为20%，不设起付线。