海南三沙治疗非典型分枝杆菌性巩膜炎的医院推荐如下：

1. 中山大学中山眼科中心

• 专业科室：该医院拥有角膜病、眼底外科、眼整形等多个专业科室，尤其在眼科疑难病治疗方面具有丰富经验。
• 地理位置：位于广州市先烈南路54号，虽然不在海南三沙，但凭借其专业的医疗资源和口碑，是治疗此类疾病的热门选择。

2. 首都医科大学附属北京同仁医院

• 眼科实力：北京同仁医院的眼科是国内顶尖的，涵盖多种复杂眼病的诊治，包括非典型分枝杆菌性巩膜炎。
• 地理位置：位于北京市，虽不在海南，但医院的技术实力和医生经验值得信赖。

3. 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院

• 专科优势：该医院在眼耳鼻喉科疾病的治疗上具有显著优势，眼科团队经验丰富。
• 地理位置：位于上海市，虽然距离海南较远，但医院的技术和设备在国内处于领先地位。

4. 浙江大学医学院附属第二医院

• 综合实力：作为一家综合性医院，其眼科在治疗疑难眼病方面表现突出。
• 地理位置：位于浙江省杭州市，同样不在海南，但医院的技术水平值得信赖。

总结与建议

虽然海南三沙地区目前未找到明确治疗非典型分枝杆菌性巩膜炎的医院信息，但以上推荐的医院均具备国内顶尖的眼科医疗资源和治疗技术。如果条件允许，建议前往这些医院就诊，以获得更专业的治疗和更好的疗效。