合作医疗的报销比例因医疗机构的级别不同而有所差异，以下是根据不同级别医疗机构的报销比例进行的计算：
住院报销
一级医疗机构：报销比例为90%。如果在乡镇卫生院住院，医疗费用为4000元，报销金额为：4000元 × 90% = 3600元。
二级医疗机构：报销比例为80%。如果在县级医院住院，医疗费用为4000元，报销金额为：4000元 × 80% = 3200元。
三级医疗机构：报销比例为60%。如果在市级医院住院，医疗费用为4000元，报销金额为：4000元 × 60% = 2400元。
大病保险报销
起付线及报销比例：大病保险起付线以上的费用按60%支付。如果4000元医疗费用超过了大病保险的起付线，那么报销金额为：4000元 × 60% = 2400元。
其他报销情况
镇风险基金补偿：如果住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上分段补偿，即5001-10000元补偿65%，10001-18000元补偿70%。如果4000元医疗费用在5001-10000元之间，报销金额为：4000元 × 65% = 2600元。
需要注意的是，不同地区的合作医疗报销政策可能会有所不同，具体的报销金额还需要根据当地的政策规定来确定。