农村合作医疗在住院期间是可以报销的，但需要满足一定的条件和流程。以下是相关要点：

报销条件

• 定点医疗机构就医：参保人员需在定点医疗机构住院治疗，才能享受农村合作医疗的报销待遇。

• 符合规定费用：报销的医疗费用需符合农村合作医疗规定的报销范围，包括药品、诊疗项目、医疗服务设施等费用。

• 起付标准：住院费用需达到当地规定的起付标准，起付标准以下的费用由个人自付。不同地区和不同级别的医疗机构起付标准可能有所不同。

报销流程

• 入院登记：参保人员在定点医疗机构住院时，需进行入院登记，提供相关证件和信息。

• 就医治疗：在住院期间，医疗机构会根据病情提供相应的治疗和护理服务。

• 出院结算：出院时，医疗机构根据农村合作医疗报销政策，结算报销金额，个人只需支付自付部分。

报销比例

• 一级医疗机构：政策范围内报销比例可达90%。

• 二级医疗机构：政策范围内报销比例可达80%。

• 三级医疗机构：政策范围内报销比例可达60%。

注意事项

• 报销范围：包括床位费、护理费、手术费、治疗费、检查费、医药费等，但需符合规定的报销目录。

• 大病报销：对于大病患者，农村合作医疗还提供大病保险报销，起付线以上的费用按60%支付，最高限额可达25万元。

综上所述，农村合作医疗在住院期间是可以报销的，但需满足定点医疗机构就医、符合规定费用等条件，并按照规定的流程进行结算。具体的报销比例和起付标准等细节，建议咨询当地的农村合作医疗管理部门或定点医疗机构，以获取最准确的信息。