门诊自费的费用是否可以用农村合作医疗报销，需要视具体情况而定：

一般情况

• 可以报销：如果是在农村合作医疗定点医疗机构就诊，并且所发生的门诊医疗费用符合当地农村合作医疗的报销范围，如符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目目录、医疗服务设施标准等，那么可以按规定比例进行报销。例如，2025年部分地区新农合普通门诊报销比例通常稳定在50%左右，乡镇级医疗机构报销比例可达70%。

• 不能报销：如果是在非定点医疗机构就诊，或者所发生的费用不在农村合作医疗的报销范围内，如一些美容整形项目、非疾病治疗的保健类项目等，这些费用是不能报销的。

特殊情况

• 两病门诊报销：对于高血压、糖尿病等“两病”患者，部分地区实施专项门诊报销政策，使用“两病”用药目录中乙类药品的，个人先需自付10%，剩余部分按规定的报销比例进行报销。

• 门诊慢性特殊病种补偿：门诊慢特病报销时不设起付线，在相应病种年度报销限额内，按新规范围内费用的70%（乙类项目先由个人自付10%后计算）进行报销。

需要注意的是，不同地区的农村合作医疗报销政策可能会有所差异，具体的报销范围、比例和条件等以当地医保部门公布的规定为准。建议在就医前咨询当地的农村合作医疗管理部门或定点医疗机构，了解详细的报销政策和流程。